Lieu culturel vivant et animé par des expositions et des animations en lien avec la Préhistoire et l’archéologie, le musée départemental de Préhistoire d’Île-de-France témoigne aussi de la politique culturelle du Conseil départemental de Seine-et-Marne : en accord avec les actions menées dans les cinq musées départementaux, mais également dans les autres lieux à vocation culturelle, il se veut un lieu de dialogue ouvert à la création contemporaine.
Il a ainsi choisi de créer aussi des liens entre le site, les collections et le domaine de la création contemporaine sous toutes ses formes (arts plastiques, photographie, littérature, arts du spectacle, etc.).
Après avoir accueilli une œuvre de Lili Cron, composée de 5 sculptures (1988), et une installation de Christian Lefèvre intitulée Le Nichoir (1990), le musée s’est résolument ouvert à l’art contemporain à partir de 2009 en donnant régulièrement carte blanche à un plasticien : l’artiste est invité à se saisir des lieux pour créer des œuvres in situ et en relation avec le musée, dont certaines resteront de façon pérenne au musée.
En 2009, il a ainsi accueilli le peintre et sculpteur Jean-Paul Marcheschi pour une exposition monographique. Quatre de ses œuvres demeurent au musée, dans le sous-bois (Horus et l’Acrobate) et au cœur des collections (Le Nocher et Le Plongeur). Puis, en 2011, le musée a accueilli une exposition de photographies de Rip Hopkins qui a réalisé une importante série de photographies nouvelles, centrées sur les personnes qui animent ou qui visitent le musée.
Par ailleurs, le musée participe tout au long de l’année aux grands événements nationaux (Journées du patrimoine, Nuit des musées…) et propose une programmation culturelle dense et variée pour tous les publics : expositions, animations, conférences...